Innhold
Polymerasekjedereaksjon (PCR) -analyse er en laboratorieteknikk. Formålet med PCR-testing er å finne små mengder DNA i en prøve ved hjelp av en prosess kjent som forsterkning. Under PCR-amplifikasjon kopieres DNA av interesse gjentatte ganger til det er nok av det til analyse og påvisning. For eksempel kan PCR brukes til å identifisere små mengder DNA fra organismer som forårsaker gonoré eller klamydia som er tilstede i en urinprøve.Hvordan fungerer PCR?
Det første trinnet i PCR er å lage grunning. Dette er korte DNA-sekvenser som samsvarer med endene av DNA-prøven du prøver å oppdage. De er trikset for å finne, forsterke og oppdage et bestemt stykke DNA. Det DNA-stykket kan brukes til å identifisere et patogen. Det kan også brukes til å gjøre ting som å oppdage gener for antibiotikaresistens.
Når du har fått dine primere, er neste trinn i PCR å varme opp prøven slik at dobbeltstrenget DNA skilles i to enkeltstrenger - dette kalles denaturering. Deretter grunningeneblir kombinert med prøve-DNA. Etter dette, et DNA polymerase brukes til å starte DNA-replikasjon på primerstedet. Til slutt varmes DNA opp for å skille strengene igjen. Med det begynner hele PCR-prosessen igjen.
Mengden av DNA-segment av interesse som er tilstede i prøven øker eksponentielt med hver PCR-syklus. I den første syklusen blir ett eksemplar to. Så blir to eksemplarer fire, så blir de åtte osv. Denne eksponensielle veksten betyr at det generelt bare er behov for 20 til 40 sykluser for å avgjøre om det aktuelle DNA er til stede. (Hvis DNA er til stede, er 20-40 sykluser også nok til å gi en tilstrekkelig prøve for analyse).
Alle trinnene i en polymerasekjedereaksjon, denaturering av DNA, påføring av primere og forlengelse av DNA, skjer ved forskjellige temperaturer. Det betyr at etter at den første blandingen er satt sammen, kan trinnene kontrolleres gjennom en prosess kjent som termosykling. Termosykling betyr at temperaturen holdes på de nødvendige nivåene akkurat lenge nok til at hvert trinn kan finne sted. Dermed er PCR en effektiv måte å amplifisere mengden mål-DNA på. Faktisk kan det oppnås i et enkelt prøverør med lite behov for menneskelig inngripen.
Polymerase-kjedereaksjon representerte en revolusjon innen biologisk teknikk da den ble utviklet først på begynnelsen av 1980-tallet. PCRs skaper, Kary Mullis, vant Nobelprisen i kjemi for sitt arbeid i 1993.
Hvorfor PCR er relevant for STD-testing
Polymerase kjedereaksjon, og relaterte teknikker som ligasekjedereaksjon, viser seg å være av økende betydning for STD-testing. Dette er fordi disse teknikkene direkte kan identifisere små mengder viralt DNA eller RNA i prøver. Å identifisere den genetiske koden til et patogen krever ikke at patogenet er i live, i motsetning til bakteriekultur eller viral kultur. Det krever heller ikke at infeksjonen har skjedd for lenge nok for at folk skal ha utviklet en påviselig antistoffreaksjon (slik infeksjoner blir oppdaget av ELISA.) Dette betyr at PCR-teknikker noen ganger kan oppdage sykdommer tidligere enn andre tester. Enda bedre, STD kan oppdages uten så mye behov for å være bekymret for å holde prøvene i live eller teste på akkurat riktig tidspunkt.
De beste STD-tester hjemme